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PROGRAMMA

PER IL PRIMO AVVIO
DELLA PIATTAFORMA PER IL GENOTYPING

Premessa

Il presente Programma disciplina le attività per il primo avvio della Piattaforma per il Genotyping, realizzata dal Consorzio Ventuno nell’ambito dell’Azione 1.a del progetto “SIAI101”, inserito nel più ampio Accordo Programma Quadro (APQ) regionale in materia di Società dell’informazione.

Il Progetto SIAI101 è volto a promuovere, tramite l’utilizzo delle tecnologie informatiche, lo sviluppo del settore della bioinformatica e della medicina personalizzata, nell’ambito dell’area di riferimento Cagliari – Pula e, su base sperimentale, nel territorio dell’Ogliastra.

L’Azione 1.a (Attrezzature e servizi di genotipizzazione) del progetto riguarda l’acquisto di importanti attrezzature di ricerca destinate ad arricchire la dotazione della filiera genomica di Polaris, per costituire una “Piattaforma per il Genotyping”, in grado di fornire agli utenti di Polaris e al sistema (non solo regionale) della ricerca e dell’innovazione di servizi di genotipizzazione, sequenziamento e di profili di espressione genica ad alta processività.

La Piattaforma per il Genotyping

La Piattaforma per il Genotyping è una struttura di Polaris la cui missione è di condurre e facilitare ricerche mirate a: 

–	comprendere le basi genetiche di patologie complesse 
–	comprendere le basi genetiche delle risposte farmacologiche
–	identificare nuovi marker genetici di rilevanza clinica
–	identificare nuovi marcatori diagnostici e “target” farmacologici
implementare procedure di genotyping ed analisi statistiche

attraverso l’utilizzo di tecniche e competenze di statistica, bioinformatica, genetica umana e genomica.

La Piattaforma è progettata per diventare una risorsa per la comunità scientifica e imprenditoriale locale, garantendo l’accesso a tecnologie ad alta processività fondamentali per progetti di ricerca biomedica avanzata.

Ulteriore obiettivo è quello di fungere da elemento di attrazione per l’insediamento a Polaris di nuove iniziative di ricerca, in particolare di imprese high tech che possano contribuire a elevare il livello scientifico e tecnologico delle attività di ricerca sviluppate all’interno di Polaris e nell’area di riferimento del progetto SIAI101.

Le attrezzature

Il programma di primo avvio riguarda, in questa prima fase, le seguenti componenti della piattaforma:

1)	Piattaforma Affymetrix
Dispone di due diversi sistemi completi Affymetrix integrabili fra loro, che permettono di gestire tutti i protocolli Affymetrix per analisi di espressione genica e di genotyping.

2)	7900HT Fast Real-Time PCR System
Lo strumento è in grado di rilevare quantitativamente la presenza di acidi nucleici in Real Time PCR, utilizzando la tecnologia TAQMAN, e di valicare polimorfismi biallelici.

Per la fase di avvio verranno resi disponibili alcuni dei reagenti necessari all’esecuzione delle sperimentazioni.

Il Programma di primo avvio

La Piattaforma per il Genotyping è concepita come una risorsa che verrà resa disponibile ad imprese e centri di ricerca; pertanto si ritiene opportuno, prima di procedere alla fase di gestione a regime e al di là del mero collaudo della funzionalità delle singole apparecchiature, introdurre una fase preliminare di avvio, che possa consentire di:

-	valutare le migliori modalità di gestione dell’accesso alla Piattaforma;
-	verificare operativamente eventuali problemi legati all’utilizzo sistematico delle stesse attrezzature;
-	stimare su casi reali la distribuzione ed il volume di attività per un funzionamento efficiente della Piattaforma;
-	perfezionare la conoscenza tecnica delle procedure e delle attrezzature da parte dello staff responsabile della gestione per raggiungere uno standard qualitativo ottimale;
-	individuare, con la collaborazione dei soggetti partecipanti, le migliori procedure di analisi statistica ed informatica dei dati da implementare nella fase di piena operatività al termine della fase pilota. 

Il programma di primo avvio si articola nelle fasi seguenti:

	Mese 1	Mese 2	Mese 3	
Definizione dei soggetti partecipanti													
Realizzazione delle attività di sperimentazione													
Valutazione dei risultati del Programma													

Fase 1 – Definizione dei soggetti partecipanti
Attraverso la raccolta di manifestazioni di interesse e la valutazione della loro coerenza con gli obiettivi e gli ambiti scientifici del Programma per il primo avvio, si intende giungere all’individuazione dei soggetti interessati alle sperimentazioni negli ambiti scientifici oggetto del Programma, e alla definizione del calendario di dettaglio per l’utilizzo della strumentazione della Piattaforma.

Fase 2 – Realizzazione delle attività di sperimentazione
Questa fase vedrà operare in stretta collaborazione i soggetti aderenti all’iniziativa e lo staff responsabile della gestione della Piattaforma, per la realizzazione degli esperimenti e delle analisi previste.

Fase 3 – Valutazione dei risultati delle attività di primo avvio
Questa fase è riferita alla valutazione del funzionamento del Programma di primo avvio nel suo complesso, in particolar modo per quanto concerne gli aspetti tecnici e gestionali della Piattaforma. A conclusione della fase sarà redatto, a cura del Consorzio Ventuno, un report sugli esiti del Programma di primo avvio, che potrà essere utilizzato anche in funzione dell’ottimizzazione delle modalità di gestione a regime della Piattaforma stessa. 

Ambiti scientifici

Le aree scientifiche nell’ambito delle quali è possibile presentare richiesta di adesione al programma di avvio sono:

1.	studi “genome-wide” volti all’identificazione di varianti genetiche associate a malattie complesse ad alto impatto sanitario nella popolazione sarda;
2.	studi più ristretti volti alla definizione di varianti genetiche polimorfiche di geni “target” direttamente coinvolti nell’insorgenza di malattie o di risposte farmacologiche;
3.	studi volti alla validazione di determinazioni mediante Real Time PCR a scopo diagnostico/predittivo.

Soggetti ammissibili e modalità di attuazione

Possono presentare richiesta di adesione al Programma:

-	imprese aventi una sede operativa nella provincia di Cagliari o nella provincia dell’Ogliastra;
-	università ed enti di ricerca pubblici con sede in Sardegna.

Il Programma è a carico del Consorzio Ventuno, che metterà a disposizione le attrezzature della Piattaforma e una quota di reagenti. I soggetti aderenti dovranno tuttavia contribuire alla riuscita del Programma partecipando attivamente con il proprio personale e competenze alle attività previste.

Eventuali costi aggiuntivi (reagenti, materiale di consumo, ecc.) necessari alle sperimentazioni saranno sostenuti dalle imprese aderenti al Programma.

Modalità di adesione

I soggetti interessati potranno presentare richiesta di adesione al Programma per il Primo avvio utilizzando il modulo apposito (Allegato A), che deve essere presentato compilato e firmato in originale entro il 20 ottobre 2006, consegnato a mano o inviato tramite raccomandata con ricevuta di ritorno al seguente indirizzo:

Consorzio Ventuno
Polaris, Edificio 2 - Loc. Piscinamanna
09010 Pula (CA)

Norme generali

Tutto il personale, nessuno escluso, è tenuto ad osservare le norme in materia di antinfortunistica, sicurezza e sanità. 

I rappresentanti legali delle imprese o i loro delegati, i responsabili degli enti di ricerca, il personale autorizzato all’utilizzo della Piattaforma e all’impiego delle apparecchiature saranno considerati responsabili per danni a persone e a cose che dovessero derivare da incuria o inosservanza delle norme antinfortunistiche e sanitarie.

All’interno della Piattaforma opereranno unicamente soggetti indicati dal Consorzio Ventuno. Qualora si rendesse necessario l’ingresso di altre persone nella Piattaforma (tecnici di manutenzione, ospiti ecc. ), esso dovrà essere preventivamente autorizzato per iscritto dal Consorzio Ventuno.

Il Consorzio Ventuno è responsabile della struttura, degli impianti e delle attrezzature contenute nella Piattaforma.

Il Consorzio Ventuno è esonerato da ogni responsabilità per danni a persone e cose causati dall’uso improprio degli impianti e delle dotazioni della Piattaforma da parte di terzi, nonché delle attrezzature, dall’ingresso di persone non autorizzate, dallo smaltimento irregolare di rifiuti speciali, tossici e nocivi, dal non rispetto delle norme di sicurezza o da altri eventi che dovessero verificarsi all’interno della struttura.

Gli impianti e la strumentazione hanno una configurazione prefissata. Nessuna modifica deve essere effettuata dal personale autorizzato all’uso o consentita ad altri soggetti. Non è possibile l’impiego di software diversi da quelli in dotazione agli impianti e alle attrezzature, anche se frutto della realizzazione da parte del personale autorizzato all’impiego.

Non è consentito lo spostamento anche temporaneo delle attrezzature o parti di esse in altri laboratori di enti di ricerca o dell’Università, o la loro localizzazione presso le imprese.

Tutte le informazioni e i dati che il personale della Piattaforma si troverà a trattare per effetto del presente Programma per il primo avvio, mantengono stretto carattere di riservatezza.

Informazioni e assistenza

Per ulteriori informazioni è possibile rivolgersi a:

Luca Contini, loc. Piscinamanna – Pula (CA) Tel. 070 92432204; fax 070 92432203
e-mail contini@consorzio21.it

Allegato A – Modulo di adesione

Il sottoscritto 	
in qualità di 	
della società/ente 	
con sede in ______________________________ Città ___________________ Prov. 	
Tel. ________________ Fax ________________ E-mail 	
P. IVA  _____________________

DOMANDA

di poter aderire al Programma per il primo avvio della Piattaforma per il Genotyping di Polaris per lo svolgimento del programma di attività di seguito sinteticamente descritto:

Obiettivi

Descrizione delle attività

	

Durata e articolazione in fasi

	

Risultati attesi

Domanda inoltre, ai fini dello svolgimento del programma di attività sopra descritto, di poter accedere all’utilizzo delle seguenti attrezzature della Piattaforma (barrare la casella corrispondente all’attrezzatura di proprio interesse; è possibile richiedere l’accesso a entrambe le attrezzature):

 Piattaforma Affymetrix

N° indicativo di campioni da analizzare: _______

 7900HT Fast Real-Time PCR System

N° indicativo di campioni da analizzare: _______

Il sottoscritto dichiara di aver preso visione del Programma per il primo avvio della Piattaforma per il Genotyping di Polaris, le cui norme si intendono accettate con la firma della presente domanda e s’impegna ad usare i locali, gli impianti e le attrezzature concesse con la massima diligenza, negli orari e per gli scopi autorizzati.

Si impegna a garantire l’anonimato dei campioni utilizzati per le sperimentazioni, e a fornirli secondo un codice identificativo concordato con il Consorzio Ventuno.

Dichiara inoltre di provvedere direttamente ad ottenere eventuali autorizzazioni previste dalle norme di legge, esonerando il Consorzio Ventuno da ogni responsabilità civile, penale o amministrativa derivante dalla mancanza dei suddetti adempimenti o da uso dei locali, degli impianti e delle attrezzature contrario all’ordine e all’incolumità pubblica.

Data
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Firma e timbro

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