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Company: Porto Conte Ricerche

PORTO CONTE RICERCHE

PROGRAMMA 
“BIOTECNOLOGIE APPLICATE ALL’AGROALIMENTARE ED ALLA ZOOTECNIA”

Progetti Cluster

Biosensori per sistemi diagnostici

Sviluppo ed utilizzo di nanodevices

Genotipizzazione ed espressione genica negli ovini

Regolamento

MAGGIO 2009

PREMESSA

Porto Conte Ricerche è soggetto attuatore del programma strategico “Biotecnologie applicate all’agroalimentare ed alla zootecnia” (Del. CTG Sardegna Ricerche 17/229), volto al rafforzamento del Cluster Tecnologico delle Biotecnologie applicate. 

Il Cluster Tecnologico, individuato e promosso dal Governo Regionale nell’ambito della Strategia Regionale per l’Innovazione (2000-2006), risponde alle esigenze delle imprese del territorio che, pur in assenza di una comune specializzazione produttiva, sono orientate all'innovazione e al trasferimento tecnologico in settori tra loro integrati per offerta di competenze e infrastrutture tecnologiche.

Nel Cluster, le attività imprenditoriali con maggiore potenzialità di sbocco nel mercato riguardano l'identificazione di marcatori molecolari (biomarkers discovery) e lo sviluppo di processi, prodotti e servizi correlati con kit immunodiagnostici, biosensori e nanobiosensori per la salute umana e animale, bioindicatori e, nel settore alimentare, marcatori molecolari e biologici identificativi della qualità e tracciabilità.

Il programma strategico “Biotecnologie applicate all’agroalimentare ed alla zootecnia” prevede l’avvio di laboratori tecnologici e la realizzazione di azioni per cluster di imprese (progetti cluster) a supporto delle imprese biotech e dei diversi settori "tradizionali" nei quali le applicazioni industriali delle biotecnologie determinano un vantaggio competitivo.

1. I PROGETTI CLUSTER
1.1. Cosa sono
I progetti cluster rappresentano il proseguimento logico delle attività di animazione per lo sviluppo delle imprese riferite alle filiere produttive per le quali esiste maggiore vocazione in ambito regionale e locale.
Il perseguimento di tale obiettivo richiede l’utilizzo di una metodologia che preveda l’uso combinato di attività di formazione, ricerca, sviluppo e sperimentazione.
Per la loro natura non commerciale e non concorrenziale i risultati sviluppati nel corso delle attività dei progetti cluster devono essere diffusi e messi a disposizione delle imprese del settore secondo criteri non discriminatori. Per questa loro caratteristica, i progetti cluster sono finanziariamente a completo carico della spesa pubblica.

1.2. Come si articolano
Il modello del progetto cluster prevede una prima fase di sensibilizzazione e informazione delle imprese potenzialmente interessate, e una fase contestuale di raccolta delle adesione delle imprese. Nel corso dell’attuazione dell’intervento le imprese dovranno fornire il proprio supporto finalizzato alla definizione delle soluzioni da perseguire, alla loro sperimentazione e validazione tecnologica. I risultati e le eventuali soluzioni identificate resteranno proprietà di Porto Conte Ricerche, che alla fine del progetto cluster, avrà il compito di diffonderli e divulgarli presso tutte le imprese/enti del settore. 

2. I PROGETTI
Il presente regolamento disciplina tre progetti cluster: 

1.	BIOSENSORI PER SISTEMI DIAGNOSTICI
2.	SVILUPPO ED UTILIZZO DI NANODEVICES
3.	GENOTIPIZZAZIONE ED ESPRESSIONE GENICA NEGLI OVINI

2.1. Quadro di riferimento
Biosensori per sistemi diagnostici.
I biosensori sono costituiti da un elemento biologico (enzimi, recettori, acidi nucleici) che è in grado di riconoscere e quantificare la presenza di molecole, ed a sua volta legato ad un trasduttore, ovvero un substrato in grado di trasformare la reazione biologica in un segnale rilevabile.
Per le nuove generazioni di biosensori si fa sempre più ricorso a nuovi materiali, in particolare nano-biotecnologici. I biosensori ed i nano biosensori sono nati e si sono diffusi inizialmente nell’ambito della salute umana (il mercato più importante è attualmente quello dei glucometri per il controllo glicemico dei pazienti diabetici). L’utilizzo di nano materiali ha dimostrato di poter migliorare sia la sensibilità che la capacità di rilevare una maggiore ampiezza di range di concentrazioni, caratteristiche che sono normalmente mutualmente esclusive in un biosensore. 
Attualmente, l’industria agro-alimentare e la zootecnia costituiscono uno dei maggiori settori target per lo sviluppo di nano-biosensori per il monitoraggio e la gestione delle produzioni alimentari animali e vegetali.
Il crescente interesse per i biosensori è particolarmente legato al basso costo del loro utilizzo operativo  per cui la ricerca e lo sviluppo di tale tecnologia si pone come traguardo di molte aziende impegnate nella diagnostica e nel controllo di processo. L’ammontare degli investimenti stimati per la ricerca in questo settore è di circa 8.2 miliardi di dollari (fine del 2009).

Sviluppo ed utilizzo di nanodevices. 
Materiali biocompatibili possono essere ingegnerizzati in nano particelle contenenti ligandi o vaccini e con proprietà simili a vettori biologici naturali come i batteri ed i virus. A titolo di esempio, i nanodevices (nano strutture di sintesi)  possono essere disegnati per interagire in maniera specifica e prevedibile con determinati tessuti o cellule, per evadere barriere fisiologiche, o ancora per stimolare le cellule che presentano l’antigene nella risposta immunitaria.
Le nanostrutture di sintesi, potendo essere controllate in funzione delle dimensioni, della forma e della chimica di superficie, si dimostrano strumenti di grande impatto scientifico e tecnologico e ad elevatissimo potenziale economico nei settori correlati alla produzione di diagnostici e vaccini in ambito agroindustriale.

Genotipizzazione ed espressione genica negli ovini.
La conoscenza delle basi genetico-molecolari responsabili di specifici fenotipi nell’ovino è da anni oggetto di studio di numerosi ricercatori in Sardegna ed è di interesse per diverse PMI nella filiera biotecnologie a motivo dell’attuale sviluppo del mercato biotech di riferimento. Con la collaborazione di tutti gli operatori che aderiranno al Cluster, si svilupperanno protocolli analitici basati sulle più recenti tecnologie ad altissima processività per la analisi di profili SNP e funzionali.
L’iniziativa è orientata alla creazione di una rete di servizi, in collaborazione con AGRIS e con altre organizzazioni di ricerca in Sardegna impegnate in studi genetico-molecolari in campo ovino, i cui destinatari sono sia le imprese della filiera biotecnologie che quelle della filiera dell’industria ovina.

2.2. Obiettivi 
Le azioni cluster, differenziate per ciascun progetto, permetteranno di acquisire:
•	Nuove strategie sintetiche per realizzare biosensori e nanobiosensori che rilevino la presenza di biomarcatori in campioni biologici di origine animale e vegetale.
•	Nuovi sistemi per il delivery di ligandi/vaccini attraverso nanodevice biocompatibili
•	I profili genetici delle popolazioni ovine in Sardegna e un database di genotipi e di espressione genica per gli studi di associazione con tratti clinici rilevanti 

Gli interventi descritti, faciliteranno la realizzazione di collaborazioni e l’acquisizione di fondi attraverso opportuni enti finanziatori nazionali ed internazionali (MIUR, NIH, UE, etc.) per progetti di ricerca ed altri progetti pilota per lo sviluppo di diagnostici innovativi ed efficaci. 

2.3. Infrastrutture
2.3.1. Piattaforma di proteomica
La Piattaforma di Tecnologie Proteomiche della Porto Conte Ricerche rappresenta attualmente uno dei laboratori più completi ed aggiornati in Italia. Le possibili applicazioni offerte dalla Piattaforma riguardano principalmente:
-	Analisi sistematica e differenziale del proteoma di un tessuto, cellula o comparto cellulare in condizioni fisio-patologiche, mediante tecniche elettroforetiche, ed identificazione delle proteine attraverso analisi di spettrometria di massa.
-	Ricerca, identificazione e caratterizzazione di marcatori peptidici e proteici.
-	Purificazione di proteine mediante tecniche cromatografiche e validazione della struttura primaria attraverso analisi di spettrometria di massa.
-	Determinazione del peso molecolare accurato di proteine e peptidi mediante spettrometria di massa
-	Identificazione di modifiche post-traduzionali.
-	Design, sintesi e purificazione peptidi.

La dotazione tecnologica comprende:
•	Sistemi per IEf e 2D Page  (Biorad e Ge Healthcare)
•	Scanner  densitometrico Image Scanner (Ge Healthcare)
•	nanoESI-Q-Tof interfacciato con HPLC capillare (Waters)
•	MALDI TOF (Waters)
•	Sintetizzatore automatico di peptidi PIONEER (Applied Biosystems) 
•	Sintetizzatore automatico di peptidi a microonde Liberty (CEM) 
•	Sequenziatore automatico di proteine e peptidi Procise (Applied Biosystems) 
•	Lettore ottico di micro piastre (Tecan)
•	HPLC semipreparativo Explorer 10 AKTA equipaggiato con lampada UV Vis, auto campionatore e raccoglitore di frazioni (GE HealthCare)

2.3.2. Piattaforma di Risonanza Magnetica e Chimica Analitica
La Piattaforma di Spettrometria NMR e Chimica Analitica è attrezzata l’identificazione di specifici biomarkers a fini diagnostici e per la certificazione chimica di sistemi biologici (compresi gli alimenti).
Le attività della Piattaforma riguardano: 
-	Sviluppo di metodiche analitiche applicate all'agroalimentare 
-	Sviluppo di metodiche di imaging molecolare applicate alla diagnostica
-	Determinazione di sostanze aromatiche, residui di farmaci e pesticidi, di indicatori di tipicità negli alimenti 
-	Certificazione di qualità in campo agroalimentare
La dotazione tecnologica comprende:
•	NMR Avance 600 MHz equipaggiato con probes per analisi in soluzione e HRMAS per campioni semisolidi (Bruker)
•	NMR Avance 300 MHz per immagini protoniche (campioni max 3 cm di diametro) (Bruker)
•	ESI Ion Trap Finnigan LCQ Deca interfacciato con un HPLC con autocampionatore (Thermo)
•	HPLC 1200 equipaggiato con lampada UV Vis, DAD, auto campionatore e raccoglitore di frazioni (Agilent)
•	HPLC SpectraSYSTEM  equipaggiato con detector DAD e fluorimetro (Thermo)
•	Assorbimento Atomico (Perkin Elmer)
•	GC-MS costituito da Gas cromatografo Autosystem XL con auto campionatore COMBIPAL per analisi dello spazio di testa accoppiato ad uno spettrometro di massa TURBOMASS con sorgente EI/CI e analizzatore quadrupolare (Perkin Elmer)

2.3.3. PIATTAFORMA MICROARRAY
La piattaforma, equipaggiata con tecnologia Bead Array Illumina, consente di svolgere servizi ed attività di ricerca nel campo della genomica funzionale su diversi livelli di throughput. 
La piattaforma microarray è multifunzionale e in grado di supportare progetti di genotipizzazione (animale e vegetale) e analisi di variazione di Copy number (CNV) su scala genomica oltre che studi dei livelli di espressione dei trascritti e di microRNA. La piattaforma è inoltre dotata di una apparecchiatura per Real Time PCR in grado di supportare per la validazione dei risultati ottenuti attraverso gli studi su scala genomica o per un approccio basato sulla selezione di geni candidati.

La dotazione tecnologica comprende:
•	Iscan microarray scanner per studi di genotipizzazione e gene expression (Illumina)
•	Realtime 7900HT +Fast 96wblock per la validazione di genotipi e gene expression (Applied Biosystems)
•	Altre attrezzature minori

2.3.4. PIATTAFORMA DI IMMUNOLOGIA MOLECOLARE
La piattaforma permette la messa a punto di sistemi di controllo delle patologie di interesse animale ed umano. Sono disponibili sistemi citofluorimetrici ed altri devices che rappresentano lo stato dell’arte per il set up di sistemi immunodiagnostici per studi molecolari quantitativi e qualitativi della risposta immunologica. La piattaforma può supportare ricerche nei seguenti ambiti:
-	Studio delle allergie e intolleranze alimentari
-	Studio delle patologie infettive 
-	Studio della risposta immunitaria in seguito alla somministrazione di vaccini 
-	Studio delle condizioni immunologiche e immunopatologiche

La dotazione tecnologica comprende:
•	Citofluorimetro Facscanto a 3 laser (Becton Dickinson)
•	Stazione automatizzata Elisa EVO 75 (Tecan) 
•	Altre attrezzature minori

2.4. Piano di lavoro
Le azioni cluster prevedono le seguenti attività, per una durata complessiva di 6 mesi:
•	Definizione del programma di dettaglio
In questa fase il progetto sarà illustrato alle imprese potenzialmente interessate, sarà definito il
programma di dettaglio delle attività sperimentali da svolgere.
•	Realizzazione delle attività sperimentali
In questa fase verranno effettuate le ricerche/sperimentazioni allo scopo di realizzare gli obiettivi indicati al punto 2.2.
•	Presentazione dei risultati
In questa fase saranno presentati alle imprese partecipanti i risultati delle attività di sperimentazione, con l’obiettivo di creare le più utili sinergie con il sistema di imprese esistente e favorire la creazione di nuove imprese orientate verso le fasi applicative e le ricadute di tipo produttivo.

2.5. Soggetti beneficiari
Sono ammessi a partecipare ai progetti “BIOSENSORI PER SISTEMI DIAGNOSTICI, SVILUPPO ED UTILIZZO DI NANODEVICES, GENOTIPIZZAZIONE ED ESPRESSIONE GENICA NEGLI OVINI ” le imprese, i dipartimenti universitari, i centri di ricerca pubblici e privati che hanno sede operativa o attività di R&S in Sardegna.

2.6. Incentivi
Il costo del progetto cluster è totalmente a carico di Porto Conte Ricerche. Le imprese/enti aderenti dovranno tuttavia contribuire alla riuscita del progetto partecipando attivamente con il proprio personale alle attività previste. I risultati finali del progetto e le eventuali soluzioni identificate resteranno proprietà di Porto Conte Ricerche per il perseguimento dei suoi fini istituzionali e saranno messi a disposizione delle imprese/enti del settore secondo criteri non discriminatori.

2.7. Modalità di adesione
Le imprese/enti interessate a partecipare alle attività del progetto dovranno compilare la manifestazione d’interesse inserita nel presente fascicolo e spedirla, via mail all’indirizzo ricerca@portocontericerche.it, 
oppure
tramite posta, a Porto Conte Ricerche Srl, loc. Tramariglio – 07040 Alghero (SS) entro il 30/06/09.

2.8. Informazioni e assistenza
Per ulteriori informazioni è possibile rivolgersi a:
Tonina Roggio, Porto Conte ricerche Srl, loc. Tramariglio – 07040 Alghero (SS)
Tel. 079 998400; Fax 079 998567; email: roggio@portocontericerche.it

Programma “BIOTECNOLOGIE APPLICATE ALL’AGROALIMENTARE E ALLA ZOOTECNICA”
Manifestazione di interesse ai progetti cluster

Il sottoscritto 	
In qualità di legale rappresentante (specificare carica) 	
della ditta/società/ente	
NOTIZIE GENERALI

Denominazione e Ragione sociale 
________________________________________________________________________

Sede legale
via                                                     cap                      città                     prov.

Sede operativa
via                                                     cap                      città                     prov.

Persona da contattare
_______________________________________________________________________
pref.        Tel.                    Cell.                    fax                           e-mail

Attività economica dell’impresa
____________________________________________cod. ISTAT_________________

CHIEDE di poter aderire al progetto cluster:

Biosensori per sistemi diagnostici 					

Sviluppo ed utilizzo di nanodevices					

Genotipizzazione ed espressione genica negli ovini			

promosso da Porto Conte Ricerche.

DATA  ______________                                                   FIRMA _____________________________

Dichiara inoltre di essere informato ai sensi e per gli effetti di cui agli artt. 7 e 11 del DLg. n° 196 del 30 giugno 2003 che i dati personali raccolti saranno trattati, anche con strumenti informatici, esclusivamente nell’ambito del procedimento per il quale la presente dichiarazione viene resa.

FIRMA _________________________________

Allegato A

SCHEDA DI RILEVAZIONE ESIGENZE

Impresa
Settore produttivo (specificare)
Prodotti/Servizi
N° dipendenti

Descrivere sinteticamente le principali esperienze aziendali connesse con la tematica del progetto/i cluster

Obiettivi finali che l’impresa intende raggiungere partecipando al del progetto/i cluster

DATA  ______________                                                   FIRMA _____________________________

Dichiara inoltre di essere informato ai sensi e per gli effetti di cui agli artt. 7 e 11 del DLg. n° 196 del 30 giugno 2003 che i dati personali raccolti saranno trattati, anche con strumenti informatici, esclusivamente nell’ambito del procedimento per il quale la presente dichiarazione viene resa.

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