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Laboratorio di Next Generation Sequencing (NGS)

Immagine sul tema del sequenziamento
La piattaforma di Sequenziamento di Nuova Generazione ha una capacità produttiva nel 2016 di 10 TBase/mese. Consente di eseguire progetti di sequenziamento su larga scala, dalla produzione del dato all'analisi.

La facility è stata utlizzata per progetti di ampie dimensioni in vari ambiti, tra cui sequenziamento completo di genomi umani, trascrittomica, metagenomica, identificazione di siti di legame sul DNA di proteine cromatiniche e regolatorie, sequenziamento dell'esoma e di regioni target.

Completano queste infrastrutture sperimentali delle pipelines di analisi dati ad alta processività specializzate all’analisi combinata di tutto il genoma, esoma e trascrittoma. I servizi di Sequenziamento di Nuova Generazione della facility sono certificati, a partire dal 2016, dal programma Propel di Illumina.

Dotazione tecnologica
- Tecnologia di sequenziamento ad alto throughput per studi ampi e complessi, tra cui il sequenziamento del genoma umano di routine
- HiSeq 2000 (Maximum Output 150-200 Gb)
- Illumina HiSeq 2500 (Maximum Output 350 Gb)
- Illumina HiSeq 3000 (Maximum Output 750 Gb)
- Sequenziamento end-to-end, integrando generazione del cluster, amplificazione, sequenziamento e analisi di dati: Illumina MiSeq

Link utili
CRS4 - Next Generation Sequencing Core Facility