Laboratorio di Bioinformatica
Il Laboratorio di Bioinformatica garantisce l'accesso alle tecnologie bioinformatiche fondamentali per la ricerca biomedica e, in particolare, per la medicina personalizzata.
Esso si avvale dell'esperienza maturata dal CRS4 nel campo delle tecnologie dell'informazione e delle comunicazioni e della competenza di un proprio team di ricerca.
Le principali attività del laboratorio sono:
1. Ricerca e sviluppo, in particolare lo sviluppo di nuovi metodi per l'analisi computazionale di dati biochimici e genetici e l'applicazione di strumenti computazionali per lo studio di problemi di rilevanza biomedica
2. Supporto e servizi finalizzati a sviluppare nuovi sistemi software e basi di dati e a fornire strumenti avanzati di bioinformatica e servizi di database alla comunità scientifica e imprenditoriale sia all'interno del Parco tecnologico che presso altri gruppi di ricerca operanti in ambito regionale
3. Formazione di giovani ricercatori.
Il laboratorio opera nelle seguenti aree di ricerca:
1. Biologia computazionale delle patologie: variazioni genetiche ed epigenetiche, analisi e modellazioni di dati da microarray
2. Informatica genomica: analisi trascrittomica e proteomica, analisi genomica comparata, splicing alternativo e regolazione genica
3. Modelli integrativi e strutture di simulazione
4. Biologia dei sistemi: reti geniche e loro analisi.
Il laboratorio gestisce inoltre un Bioportale (www.bioinformatica.crs4.org) che consente l'accesso a strumenti e basi dati di bioinformatica.
Il laboratorio dispone di:
1. Software e database per:
- Analisi di sequenze
- Modellizzazione di proteine e analisi di strutture
- Genotyping
- Espressione genica
2. Hardware:
- Sistema per la gestione di grandi moli di dati con 20 nodi di elaborazione dotati di CPU a 64-bit
- Apparati di comunicazione ad alta velocità in grado di supportare moduli Ethernet/FastEthernet, moduli Gigabit Ethernet in rame e in fibra e connessioni a 10Gbit Ethernet
- Server per la connessione di fibre con sistema ottico
- Cluster computazionali con 48 nodi di elaborazione Opteron 265
- Cluster con FPGA integrati Cray XD1.
Esso si avvale dell'esperienza maturata dal CRS4 nel campo delle tecnologie dell'informazione e delle comunicazioni e della competenza di un proprio team di ricerca.
Le principali attività del laboratorio sono:
1. Ricerca e sviluppo, in particolare lo sviluppo di nuovi metodi per l'analisi computazionale di dati biochimici e genetici e l'applicazione di strumenti computazionali per lo studio di problemi di rilevanza biomedica
2. Supporto e servizi finalizzati a sviluppare nuovi sistemi software e basi di dati e a fornire strumenti avanzati di bioinformatica e servizi di database alla comunità scientifica e imprenditoriale sia all'interno del Parco tecnologico che presso altri gruppi di ricerca operanti in ambito regionale
3. Formazione di giovani ricercatori.
Il laboratorio opera nelle seguenti aree di ricerca:
1. Biologia computazionale delle patologie: variazioni genetiche ed epigenetiche, analisi e modellazioni di dati da microarray
2. Informatica genomica: analisi trascrittomica e proteomica, analisi genomica comparata, splicing alternativo e regolazione genica
3. Modelli integrativi e strutture di simulazione
4. Biologia dei sistemi: reti geniche e loro analisi.
Il laboratorio gestisce inoltre un Bioportale (www.bioinformatica.crs4.org) che consente l'accesso a strumenti e basi dati di bioinformatica.
Il laboratorio dispone di:
1. Software e database per:
- Analisi di sequenze
- Modellizzazione di proteine e analisi di strutture
- Genotyping
- Espressione genica
2. Hardware:
- Sistema per la gestione di grandi moli di dati con 20 nodi di elaborazione dotati di CPU a 64-bit
- Apparati di comunicazione ad alta velocità in grado di supportare moduli Ethernet/FastEthernet, moduli Gigabit Ethernet in rame e in fibra e connessioni a 10Gbit Ethernet
- Server per la connessione di fibre con sistema ottico
- Cluster computazionali con 48 nodi di elaborazione Opteron 265
- Cluster con FPGA integrati Cray XD1.
