Progetto Cluster - Bioinformatica
Soggetto attuatore
CRS4 surl
Descrizione
All'interno del Distretto Tecnologico della Biomedicina, con particolare concentrazione nell'area Cagliari–Pula e nel Parco scientifico e tecnologico della Sardegna, sono insediate imprese e centri di ricerca che si occupano della produzione, con esperimenti di laboratorio, di dati biologici, genetici e farmacologici.
Il lavoro in laboratorio è seguito da un'attività di analisi dei dati al computer, con l'uso di strumenti bioinformatici, quali database e software dedicati; alcuni strumenti sono accessibili gratuitamente dal Web, altri sono prodotti commerciali.
Centri specializzati in bioinformatica rendono disponibili, attraverso siti Web, dati e strumenti di analisi, a cui possono accedere tutti i ricercatori in possesso di una connessione Internet. I centri più importanti si trovano negli Stati Uniti (NCBI), in Gran Bretagna (EBI) e in Giappone (DDBJ).
Attualmente le imprese biomediche e i centri di ricerca del territorio possono accedere agli strumenti bioinformatici attraverso un BioPortale realizzato dal CRS4 all'interno del Parco tecnologico della Sardegna, nell'ambito del Progetto di Bioinformatica e medicina personalizzata.
Obiettivi
Il principale obiettivo del progetto cluster consiste nell'arricchire il portafoglio dei servizi offerti alle imprese del comparto, con strumenti bioinformatici scelti e realizzati sulla base delle loro specifiche esigenze. Tali servizi saranno resi fruibili attraverso il BioPortale realizzato dal CRS4. Nell'ambito del progetto è prevista l'organizzazione di seminari e workshop formativi che rappresentano occasioni d'incontro e di scambio di informazioni tra gestori del portale e utenti.
Risultati attesi
Il progetto prevede principalmente lo sviluppo di applicazioni bioinformatiche, che avverrà per cinque differenti aree di interesse, anche queste selezionate considerando le tematiche di ricerca in cui sono attualmente impegnate le organizzazioni e le imprese del territorio e quelle che saranno le tematiche del prossimo futuro:
1. Database (WP1)
2. Strumenti per gestione e analisi di dati genetici e genealogici (WP2)
3. Strumenti per gestione e analisi di dati di MicroArray (WP3)
4. Strumenti per gestione e analisi di dati di proteomica (WP4)
5. Data and text mining (WP5)
La conduzione del progetto prevede il massimo coinvolgimento delle imprese e delle organizzazioni utenti, con l'organizzazione di:
1. incontri con la comunità utenti
2. workshop e corsi di formazione su strumenti e tecnologie
3. fasi di co-progettazione e co-sviluppo tra gestori del BioPortale e gli utenti per la progettazione e lo sviluppo dei software bioinformatici
4. produzione di documentazione scritta per i software studiati e installati durante la realizzazione del progetto.
Finanziamenti
Fondi Regione Autonoma della Sardegna.
Tempi di realizzazione
15 mesi
Data inizio: settembre 2006
Data fine: dicembre 2007
Documenti correlati
RELAZIONI DI PRESENTAZIONE
G. Serra: "Presentazione Progetto Cluster"
P. Rodriguez Tomè: "Presentazione Progetto Cluster"
ALTRI DOCUMENTI
Relazione finale [file.pdf]
Link utili
CRS4 surl - Centro Ricerca, Sviluppo e Studi Superiori in Sardegna
CRS4 surl
Descrizione
All'interno del Distretto Tecnologico della Biomedicina, con particolare concentrazione nell'area Cagliari–Pula e nel Parco scientifico e tecnologico della Sardegna, sono insediate imprese e centri di ricerca che si occupano della produzione, con esperimenti di laboratorio, di dati biologici, genetici e farmacologici.
Il lavoro in laboratorio è seguito da un'attività di analisi dei dati al computer, con l'uso di strumenti bioinformatici, quali database e software dedicati; alcuni strumenti sono accessibili gratuitamente dal Web, altri sono prodotti commerciali.
Centri specializzati in bioinformatica rendono disponibili, attraverso siti Web, dati e strumenti di analisi, a cui possono accedere tutti i ricercatori in possesso di una connessione Internet. I centri più importanti si trovano negli Stati Uniti (NCBI), in Gran Bretagna (EBI) e in Giappone (DDBJ).
Attualmente le imprese biomediche e i centri di ricerca del territorio possono accedere agli strumenti bioinformatici attraverso un BioPortale realizzato dal CRS4 all'interno del Parco tecnologico della Sardegna, nell'ambito del Progetto di Bioinformatica e medicina personalizzata.
Obiettivi
Il principale obiettivo del progetto cluster consiste nell'arricchire il portafoglio dei servizi offerti alle imprese del comparto, con strumenti bioinformatici scelti e realizzati sulla base delle loro specifiche esigenze. Tali servizi saranno resi fruibili attraverso il BioPortale realizzato dal CRS4. Nell'ambito del progetto è prevista l'organizzazione di seminari e workshop formativi che rappresentano occasioni d'incontro e di scambio di informazioni tra gestori del portale e utenti.
Risultati attesi
Il progetto prevede principalmente lo sviluppo di applicazioni bioinformatiche, che avverrà per cinque differenti aree di interesse, anche queste selezionate considerando le tematiche di ricerca in cui sono attualmente impegnate le organizzazioni e le imprese del territorio e quelle che saranno le tematiche del prossimo futuro:
1. Database (WP1)
2. Strumenti per gestione e analisi di dati genetici e genealogici (WP2)
3. Strumenti per gestione e analisi di dati di MicroArray (WP3)
4. Strumenti per gestione e analisi di dati di proteomica (WP4)
5. Data and text mining (WP5)
La conduzione del progetto prevede il massimo coinvolgimento delle imprese e delle organizzazioni utenti, con l'organizzazione di:
1. incontri con la comunità utenti
2. workshop e corsi di formazione su strumenti e tecnologie
3. fasi di co-progettazione e co-sviluppo tra gestori del BioPortale e gli utenti per la progettazione e lo sviluppo dei software bioinformatici
4. produzione di documentazione scritta per i software studiati e installati durante la realizzazione del progetto.
Finanziamenti
Fondi Regione Autonoma della Sardegna.
Tempi di realizzazione
15 mesi
Data inizio: settembre 2006
Data fine: dicembre 2007
Documenti correlati
RELAZIONI DI PRESENTAZIONE
G. Serra: "Presentazione Progetto Cluster"
P. Rodriguez Tomè: "Presentazione Progetto Cluster"
ALTRI DOCUMENTI
Relazione finale [file.pdf]
Link utili
CRS4 surl - Centro Ricerca, Sviluppo e Studi Superiori in Sardegna
