Progetto cluster Bioinformatica: disponibili su richiesta i risultati
08.09.2009
Il progetto cluster Bioinformatica, conclusosi nel 2007, ha permesso lo sviluppo di numerose applicazioni bioinformatiche. A partire da oggi, i soggetti interessati a fruire degli strumenti realizzati nell'ambito di tale progetto possono far pervenire la loro richiesta a:
Sardegna Ricerche
Edificio 2
Ufficio Valorizzazione dei Risultati della Ricerca
Loc. Piscinamanna
09010 Pula (CA)
Applicazioni bioinformatiche sviluppate nell'ambito del progetto
ANDHIRA: database pensato per organizzare e gestire testi e immagini sulle proprietà botaniche, fitochimiche e farmaceutiche delle piante sarde.
Attraverso il Andhira sono stati sviluppati:
- lo schema di un database (SQL/PosgreSQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata dal Web (PhP).
DBCYP: database per i dati sul Citocromi P450.
Attraverso il DBCYP sono stati sviluppati:
- lo schema di un database (SQL/MySQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata dal Web (java/Tomcat).
Gel2App: programma per l'analisi di immagine dei gel 2D. Il programma scompone le immagini in componenti più piccole, attraverso l'analisi delle quali si cerca di catalogare le immagini in categorie definite.
Attraverso Gel2App è stato sviluppato il software system per l'analisi di immagini di gel 2D (C, R, HTML)HM.
HatMart: applicazione realizzata dal gruppo Servizi e sviluppo del Laboratorio di Bioinformatica, scritta in java, che permette di interrogare database basati sul sistema BioMart. Attraverso HatMart è stato sviluppato un software scritto in Java.
LaPsusProduct: applicazione progettata e sviluppata dal Laboratorio di Bioinformatica per effettuare ricerche complesse su PubMed in poco tempo.
Attraverso LaPsusProduct è stato sviluppato un prodotto ZOPE scritto in Python.
MMsINC: estensione del progetto ANDHIRA realizzato in collaborazione con l'Università di Padova. Attraverso MMsINC è stato sviluppato lo schema di un database (SQL/PosgreSQL).
PGDS (Portable Genetic Database System): il progetto ha avuto come obiettivo quello di adempiere ai particolari requisiti informatici delle analisi di dati genotipici e genealogici con lo scopo di individuare caratteristiche genetiche correlate allo sviluppo di patologie. Attraverso PGDS sono stati sviluppati:
- lo schema di un database per lo stoccaggio dei dati genotipici e genealogici (SQL/PostgreSQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata al fine di fornire assistenza in caso di aumento della produttività e di tutelare la riservatezza dei dati secondo la normativa europea (Ruby on Rails).
Sardegna Ricerche
Edificio 2
Ufficio Valorizzazione dei Risultati della Ricerca
Loc. Piscinamanna
09010 Pula (CA)
Applicazioni bioinformatiche sviluppate nell'ambito del progetto
ANDHIRA: database pensato per organizzare e gestire testi e immagini sulle proprietà botaniche, fitochimiche e farmaceutiche delle piante sarde.
Attraverso il Andhira sono stati sviluppati:
- lo schema di un database (SQL/PosgreSQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata dal Web (PhP).
DBCYP: database per i dati sul Citocromi P450.
Attraverso il DBCYP sono stati sviluppati:
- lo schema di un database (SQL/MySQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata dal Web (java/Tomcat).
Gel2App: programma per l'analisi di immagine dei gel 2D. Il programma scompone le immagini in componenti più piccole, attraverso l'analisi delle quali si cerca di catalogare le immagini in categorie definite.
Attraverso Gel2App è stato sviluppato il software system per l'analisi di immagini di gel 2D (C, R, HTML)HM.
HatMart: applicazione realizzata dal gruppo Servizi e sviluppo del Laboratorio di Bioinformatica, scritta in java, che permette di interrogare database basati sul sistema BioMart. Attraverso HatMart è stato sviluppato un software scritto in Java.
LaPsusProduct: applicazione progettata e sviluppata dal Laboratorio di Bioinformatica per effettuare ricerche complesse su PubMed in poco tempo.
Attraverso LaPsusProduct è stato sviluppato un prodotto ZOPE scritto in Python.
MMsINC: estensione del progetto ANDHIRA realizzato in collaborazione con l'Università di Padova. Attraverso MMsINC è stato sviluppato lo schema di un database (SQL/PosgreSQL).
PGDS (Portable Genetic Database System): il progetto ha avuto come obiettivo quello di adempiere ai particolari requisiti informatici delle analisi di dati genotipici e genealogici con lo scopo di individuare caratteristiche genetiche correlate allo sviluppo di patologie. Attraverso PGDS sono stati sviluppati:
- lo schema di un database per lo stoccaggio dei dati genotipici e genealogici (SQL/PostgreSQL)
- i software necessari per accedere ai dati in maniera efficiente e controllata al fine di fornire assistenza in caso di aumento della produttività e di tutelare la riservatezza dei dati secondo la normativa europea (Ruby on Rails).
